| Název předmětu | Bioinformatika |
|---|---|
| Kód předmětu | KBBV/C555 |
| Organizační forma výuky | Seminář |
| Úroveň předmětu | Bakalářský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Letní |
| Počet ECTS kreditů | 2 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinný, Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. týden Historie a úvod do předmětu - informační technologie, informační systémy, PC sítě. Internet - připojení, IP adresování, struktura URL adresy. Internet jako zdroj informací - vyhledávací nástroje, Booleovské operátory. 2. týden Zdravotnická informatika - tvorba odborných textů v akademickém prostředí, typy vědeckých publikací, vzdálený přístup k informacím, vyhledávání vědeckých informací. Pravidla psaní závěrečných prací, citování, plagiátorství. CrossRef, DOI. 3. týden Elektronické informační zdroje - uživatelské prostředí, možnosti vyhledávání a ovládání (Web of Science, Primo, Scopus, ProQuest, SpringerLink, Wiley, ScienceDirect, aj.), příklady. 4. týden Elektronické informační zdroje - řešení praktických příkladů. Analýza dat v literatuře. 5. týden Bioinformatika v praxi - základy vyhledávání ve vybraných biologických databázích. 6. týden Laboratorní informační systémy - charakteristika, struktura, funkce systémů. 7. týden Laboratorní informační systémy - základy ovládání OpenLIMS. 8. týden MS Excel - uživatelské prostředí, základní funkce, vnořené funkce, grafy funkcí. Zpracování a vyhodnocení experimentálních dat. 9. týden MS Excel - import experimentálních biologických dat z externích souborů a databází. Práce s rozsáhlými datovými soubory - třídění, filtrování dat, kontingenční tabulky a grafy. 10. týden Práce s biologickými experimentálními daty - základní matematicko-statistická analýza experimentálních dat - vybrané statistické charakteristiky, statistická analýza. 11. týden Práce s biologickými experimentálními daty - interpretace výsledků, statistické hodnocení hypotéz.
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Metody práce s textem (učebnicí, knihou), Nácvik dovedností |
| Výstupy z učení |
|
Předmět seznamuje studenty se základy informačních technologií, počítačovými sítěmi a počítačovou sítí Internet. Významná část výuky je věnována zdravotnické informatice, vyhledávání elektronických informačních zdrojů a základům bioinformatiky v praxi. Dále jsou studenti seznámeni s laboratorními informačními systémy a jejich ovládáním. Několik seminářů je věnováno interpretaci experimentálních dat a práci s biologickými daty a jejich základním statistickém hodnocení. Výuka probíhá ve specializovaných učebnách vybavených PC s potřebným SW, vyhledávání informací pomocí databázových systémů a základů práce v LIS/OpenLIMS.
|
| Předpoklady |
|
Základní dovednosti s prací na osobním počítači a v síti Internet. Základní znalosti programů Microsoft Office.
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Písemná zkouška
Praktické ovládání řešené problematiky je oveřeno vypracováním zadaných otázek a úkolů (teorie 20 %, interpretace experimentálních dat 40 % a informační databáze 40 %). |
| Doporučená literatura |
|
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr |
|---|