| Název předmětu | Modelování struktury a vlastností organických látek |
|---|---|
| Kód předmětu | UOCHT/C800 |
| Organizační forma výuky | Přednáška + Seminář |
| Úroveň předmětu | Magisterský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Zimní |
| Počet ECTS kreditů | 4 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Povinně-volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
1. týden základy výpočetní chemie, Schrodingerova rovnice a aproximace umožňujícífg její řešení. 2. týden zápis molekul, souřadnice, způsoby zadávání do výpočetních SW. (ChemSketch, GaussView, ArgusLab, OpenBabel a další). Export struktur získaných CCDC a PDB databází. 3.- 5. týden seznámení se semiempirickými (AM1, PMx, ..), HF, post HF (MP2, CCSD, QCISD, ..) a DFT metodami. Vliv báze na přesnost získaných výsledků. 6. týden zadávání úloh do SW Gaussian 7. týden výpočty energií molekul, optimalizace geometrií, výpočty frekvencí, orbitalů a jejich vizualizace, výpočty nábojů, NBO 8.-11. týden výpočty reakčních profilů, tranzitních stavů (TS, QST2, QST3), excitovaných stavů (ZINDO, CIS, TD-DFT, EOMCCSD), vlivu solvatace (PCM, SMD, COSMO) a predikce spekter (IR, NMR, UV-Vis). 12.-13. týden molekulová mechanika a další výpočetní metody jako QSAR či Molekulární Docking.
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| Přednášení, Nácvik dovedností |
| Výstupy z učení |
|
Cílem předmětu je naučit studenty základní metody výpočetní chemie a práci se software, který tyto výpočty umožňuje. V neposlední řadě pak výsledky interpretovat a vizualizovat.
Student bude po absolvování předmětu schopen kriticky zhodnotit výsledky z literatury a dále pak samostatně modelovat různé chemické sloučeniny, predikovat jejich vlastnosti a popsat jejich reaktivitu. Základem je práce se software Gaussian doplněná i o další výpočetní programy. |
| Předpoklady |
|
Základní znalost Organické a Fyzikální chemie
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Ústní zkouška, Obhajoba vlastního projektu
ústní zkouška, semestrální práce |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr |
|---|