Předmět: Metody buněčné biologie

« Zpět
Název předmětu Metody buněčné biologie
Kód předmětu KBBV/C426
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia 2
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 3
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Bílková Zuzana, prof. RNDr. Ph.D.
  • Šmíd Lenka, Mgr. Ph.D.
  • Královec Karel, RNDr. Ph.D.
  • Havelek Radim, RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Časový rozvrh přednášek: 1. týden: Vybavení a provoz buněčné laboratoře, zásady bezpečné práce s buněčnými liniemi, sterilní režim, technické zabezpečení, příprava pufrů a transportních médií, využití buněčných linií. 2. týden: Metody kultivace buněk in vitro: kultivační média, povrchy a podmínky, základy kultivačních technik, primokultury a buněčné linie, kryoprezervace, transport buněčných linií. 3. týden: Růst adherentních buněk, techniky enzymatické disociace, pasážování, růstová křivka, stanovení počtu, velikosti a viability buněk, kinetické charakteristiky, průtokové analyzátory buněk. 4. týden: Kultivace na přírodních a artificiálních nosičích, kultivace buněk v suspenzi, izolace lidských buněk, separace buněk na gradientu (Ficoll, Percoll, Lymfoprep), separace buněk pomocí imunomagnetických nosičů. 5. týden: Manipulace s buňkami: stimulace/inhibice proliferace, indukce/inhibice apoptózy, diferenciace buněk, cytotoxicita, proliferační testy, stanovení proteinů, hormonů nebo cytokinů v mediu. 6. týden: Monitorování buněk v reálném čase, migrace buněk, využití nanotechnologie, metody tkáňového inženýrství, automatické stanice pro kultivaci buněčných linií v regenerativní medicíně. 7. týden: Průtoková cytometrie: princip průtokové cytometrie, stavba průtokového cytometru, teorie kompenzace, analýza dat z průtokového cytometru. 8. týden: Aplikace průtokové cytometrie: fenotypizace buněčných linií, ověření diferenciace kmene, stanovení buněčného cyklu, buněčné viability, časné a pozdní apoptózy, ROS a další aplikace, sortování buněk pomocí FACS. 9. týden: Příprava buněčného lyzátu pro Western blotting a RT-PCR, izolace RNA a cDNA pro kvantifikaci specifických proteinů, DNA/RNA čipy, single cell analysis. 10. týden: Mikroskopické metody: typy mikroskopických objektů, mikroskopie světlého pole, mikroskopie v temném poli, fázově kontrastní mikroskopie, interferenční mikroskopie (Nomarského diferenciální interferenční kontrast, Hofmanův modulační kontrast). 11. týden: Fluorescenční mikroskopické metody: konstrukce fluorescenčního mikroskopu, fluorochromy, fluorescenční proteiny, konfokální mikroskopie, multifluorescenční konfokální mikroskopie, multifotonová konfokální mikroskopie, FRAP, FRET, TIRF. 12. týden: Snímání a zpracování fluorescenčního obrazu: multikanálové snímání, morfometrická analýza, automatizovaná měření, měření intenzity fluorescence, 3-D rekonstrukce objektů. 13. týden: Identifikace buněčné linie pomocí imunocytochemické identifikace povrchových CD znaků, specifické receptory a povrchové molekuly, detekce apoptotických buněk: stanovení apoptotického indexu - barvení pomocí DAPI. 14. týden: Závěrečný test.

Studijní aktivity a metody výuky
Monologická (výklad, přednáška, instruktáž), Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Metody práce s textem (učebnicí, knihou)
Výstupy z učení
Předmět navazuje na předmět cytologie a molekulární biologie a genetika. Cílem předmětu je seznámit studenty s konvenčními i moderními metodami analýzy buněk. Studenti jsou seznámeni s vybavením a provozem buněčné laboratoře a metodami prezervace a kultivace buněk in vitro. Studenti získají znalosti o základních i pokročilých metodách buněčné analýzy, včetně metod určení expresního profilu buněk a metod sloužících k hodnocení buněčné diferenciace, proliferace a apoptózy. Předmět je úvodem pro speciální předměty např. molekulárně biologické metody, kmenové buňky a tkáňové inženýrství, atd.

Předpoklady
nespecifikováno

Hodnoticí metody a kritéria
Písemná zkouška, Obhajoba vlastního projektu, Prezentace

Prezentace vlastního projektu Písemná zkouška
Doporučená literatura


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Fakulta chemicko-technologická Studijní plán (Verze): Bioanalytik (2013) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Fakulta chemicko-technologická Studijní plán (Verze): Bioanalytik (2016) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Fakulta chemicko-technologická Studijní plán (Verze): Bioanalytik (2015) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní