V předkládané práci byla studována možnost vazby peptidů na vanadocenový fragment. Peptidy mají více vazebných možností pro koordinaci k vanadocenovému fragmentu. Proto byly pro popis vazebné interakce nejprve použity jednodušší modelové sloučeniny N-acetylglycin a glycinamid. Na základě EPR, ESI MS, IR a RTG dat bylo potvrzeno, že N-acetylglycin se k vanadocenovému fragmentu váže za vzniku monodentátního [Cp2V(OH2)(acgly)]+ nebo chelátového [Cp2V(O,O-acgly)]+ komplexu. Glycinamid se k vanadocenovému fragmentu váže chelátovým typem vazby za vzniku komplexu [Cp2V(N,O-gly-NH2]2+. Dále byly charakterizovány vazebné interakce s peptidy. Ve vodném prostředí za fyziologického pH byly u všech studovaných peptidů popsány dva strukturní typy analogické s modelovými systémy. Sloučeniny, které byly izolovány, obsahují vanadocenový fragment s N,O-chelátově nebo O,O-chelátově vázaným peptidem. Zjištěné vazebné interakce vanadocenový fragment-peptid, však ještě nejsou nezvratným důkazem, že peptidy hrají zásadní roli v mechanismu antitumorového účinku vanadocendichloridu. Nicméně podporují závěry biologických studií, které naznačují, že inhibice replikace DNA není způsobena přímou interakcí s DNA, ale zablokováním funkce procesních enzymů.
Anotace v angličtině
Present work describes the binding possibility of peptides to vanadocene fragment. Peptides have multiple binding possibilities for coordination to vanadocene fragment. Therefore, simple model compounds N-acetylglycine and glycinamide were used for description of the bonding interactions. Based on EPR, ESI MS, IR and X-ray data, it was confirmed that the N-acetylglycine forms with vanadocene fragment monodentate [Cp2V(OH2)(acgly)]+ or chelate complex [Cp2V(O,O-acgly)]+. Reaction of glycinamide with vanadocene fragment gives chelate complex [Cp2V(N,O-gly-NH2]2+. Hereafter, bonding interactions with peptides were studied. Two structure types were described for all the studied peptides in aqueous media under physiological pH. The obtained compounds contain vanadocene fragment with N,O-bonded or O,O-bonded peptide. However, the identified bonding interactions vanadocene-peptide have not proven that peptide play the important role in the mechanism of antitumor action of vanadocene dichloride. Nevertheless, they support the conclusions of biological studies, which suggest that inhibition of DNA replication is not caused by direct interaction with DNA but through interaction with process enzymes.
V předkládané práci byla studována možnost vazby peptidů na vanadocenový fragment. Peptidy mají více vazebných možností pro koordinaci k vanadocenovému fragmentu. Proto byly pro popis vazebné interakce nejprve použity jednodušší modelové sloučeniny N-acetylglycin a glycinamid. Na základě EPR, ESI MS, IR a RTG dat bylo potvrzeno, že N-acetylglycin se k vanadocenovému fragmentu váže za vzniku monodentátního [Cp2V(OH2)(acgly)]+ nebo chelátového [Cp2V(O,O-acgly)]+ komplexu. Glycinamid se k vanadocenovému fragmentu váže chelátovým typem vazby za vzniku komplexu [Cp2V(N,O-gly-NH2]2+. Dále byly charakterizovány vazebné interakce s peptidy. Ve vodném prostředí za fyziologického pH byly u všech studovaných peptidů popsány dva strukturní typy analogické s modelovými systémy. Sloučeniny, které byly izolovány, obsahují vanadocenový fragment s N,O-chelátově nebo O,O-chelátově vázaným peptidem. Zjištěné vazebné interakce vanadocenový fragment-peptid, však ještě nejsou nezvratným důkazem, že peptidy hrají zásadní roli v mechanismu antitumorového účinku vanadocendichloridu. Nicméně podporují závěry biologických studií, které naznačují, že inhibice replikace DNA není způsobena přímou interakcí s DNA, ale zablokováním funkce procesních enzymů.
Anotace v angličtině
Present work describes the binding possibility of peptides to vanadocene fragment. Peptides have multiple binding possibilities for coordination to vanadocene fragment. Therefore, simple model compounds N-acetylglycine and glycinamide were used for description of the bonding interactions. Based on EPR, ESI MS, IR and X-ray data, it was confirmed that the N-acetylglycine forms with vanadocene fragment monodentate [Cp2V(OH2)(acgly)]+ or chelate complex [Cp2V(O,O-acgly)]+. Reaction of glycinamide with vanadocene fragment gives chelate complex [Cp2V(N,O-gly-NH2]2+. Hereafter, bonding interactions with peptides were studied. Two structure types were described for all the studied peptides in aqueous media under physiological pH. The obtained compounds contain vanadocene fragment with N,O-bonded or O,O-bonded peptide. However, the identified bonding interactions vanadocene-peptide have not proven that peptide play the important role in the mechanism of antitumor action of vanadocene dichloride. Nevertheless, they support the conclusions of biological studies, which suggest that inhibition of DNA replication is not caused by direct interaction with DNA but through interaction with process enzymes.
1. Zpracujte literární rešerši o cytostaticky aktivních metallocenových komplexech se zaměřením na jejich interakci s bioligandy.
2. Pomocí EPR spektroskopie studujte interakci vanadocenového fragmentu s modelovými sloučeninami acetylglycinem, glycinamidem a následně pak s dostupnými dipeptidy.
3. Izolované komplexy charakterizujte pomocí vhodných analytických a spektroskopických metod
Zásady pro vypracování
1. Zpracujte literární rešerši o cytostaticky aktivních metallocenových komplexech se zaměřením na jejich interakci s bioligandy.
2. Pomocí EPR spektroskopie studujte interakci vanadocenového fragmentu s modelovými sloučeninami acetylglycinem, glycinamidem a následně pak s dostupnými dipeptidy.
3. Izolované komplexy charakterizujte pomocí vhodných analytických a spektroskopických metod
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucího práce.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucího práce.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Diplomantka seznámila komisi se svojí diplomovou prací.
Dále reagovala na připomínky oponenta.
Zodpověděla otázky členů komise:
Byly zkoumány G izotropní a anizotropní faktory?
Diskutujte reakci reakci s acetonem.
Byla zkoumána kinetika reakcí?
Diskutujte strukturu sloučeniny diaqua komplexu.