Práce je zaměřena na výskyt bakterií rodu Aeromonas v technologicky neupravených zdrojích pitných vod. Celkem bylo zpracováno 40 vzorků vod odebraných v různých místech České republiky, přičemţ u kaţdého vzorku byl stanovován počet bakterii rodu Aeromonas ve srovnání s kráceným mikrobiologickým rozborem, který zahrnoval stanovení celkových počtů mikroorganismů při 22 °C a 36 °C, počtu enterokoků, koliformních bakterií a E. coli klasickými kultivačními technikami. Bylo analyzováno 23 vzorků vod ze studen a 17 vzorků vod z přírodních studánek. U vzorků studničních vod byl zaznamenán výskyt 0,08 % enterokoků, 3,89 % koliformních bakterií, 0,06 % E. coli a 3,49 % aeromonád, zatímco ve studánkách bylo stanoveno 0,07 % enterokoků, 13,39 % koliformních bakterií, 0,33 % E. coli a 11,25 % aeromonád. Dále byla optimalizována metoda real-time PCR pro stanovení bakterií rodu Aeromonas přímo ve vzorcích vod. U 5 vybraných vzorků vod bylo provedeno porovnávání dvou komerčně dodávaných kitů pro real-time PCR - SYBR? Green JumpStartTM Taq ReadyMixTM a KAPA SYBR? fast qPCR kit. Výsledky získané metodou real-time PCR byly porovnány s výsledky získanými klasickými kultivačními technikami.
Anotace v angličtině
This work is focused on demonstrating the presence of Aeromonas genus in technological raw drinking water supply. A 40 water samples from different region of the Czech Republic were compiled. An Aeromonas genus in comparison with reduced microbiological analysis of each water sample was determined. A heterothropic plate count at 22 °C as well as at 36 °C together with number of enterococci, coliform bacteria and E. coli using classical cultivation techniques were defined. 23 well water compared to 17 natural spring water samples were analyzed which resulted in the presence of 0.08 % of enterococci, 3.89 % of coliform bacteria, 0.06 % of E. coli and 3.49 % of Aeromonas genus for studied well water. On contrary in collected natural spring samples 0.07 % of enterococci, 13.39 % of coliform bacteria, 0.33 % of E. coli and 11.25 % Aeromonas genus were observed. It was optimized method real-time PCR for detection Aeromonas genus directly in water samples. For 5 selected water samples were performed comparing two commercially available kits for real-time PCR - SYBR? Green JumpStartTM Taq ReadyMixTM and KAPA SYBR? fast qPCR kit. The results obtained by method real-time PCR were compared with results obtaining using classical cultivation techniques.
Práce je zaměřena na výskyt bakterií rodu Aeromonas v technologicky neupravených zdrojích pitných vod. Celkem bylo zpracováno 40 vzorků vod odebraných v různých místech České republiky, přičemţ u kaţdého vzorku byl stanovován počet bakterii rodu Aeromonas ve srovnání s kráceným mikrobiologickým rozborem, který zahrnoval stanovení celkových počtů mikroorganismů při 22 °C a 36 °C, počtu enterokoků, koliformních bakterií a E. coli klasickými kultivačními technikami. Bylo analyzováno 23 vzorků vod ze studen a 17 vzorků vod z přírodních studánek. U vzorků studničních vod byl zaznamenán výskyt 0,08 % enterokoků, 3,89 % koliformních bakterií, 0,06 % E. coli a 3,49 % aeromonád, zatímco ve studánkách bylo stanoveno 0,07 % enterokoků, 13,39 % koliformních bakterií, 0,33 % E. coli a 11,25 % aeromonád. Dále byla optimalizována metoda real-time PCR pro stanovení bakterií rodu Aeromonas přímo ve vzorcích vod. U 5 vybraných vzorků vod bylo provedeno porovnávání dvou komerčně dodávaných kitů pro real-time PCR - SYBR? Green JumpStartTM Taq ReadyMixTM a KAPA SYBR? fast qPCR kit. Výsledky získané metodou real-time PCR byly porovnány s výsledky získanými klasickými kultivačními technikami.
Anotace v angličtině
This work is focused on demonstrating the presence of Aeromonas genus in technological raw drinking water supply. A 40 water samples from different region of the Czech Republic were compiled. An Aeromonas genus in comparison with reduced microbiological analysis of each water sample was determined. A heterothropic plate count at 22 °C as well as at 36 °C together with number of enterococci, coliform bacteria and E. coli using classical cultivation techniques were defined. 23 well water compared to 17 natural spring water samples were analyzed which resulted in the presence of 0.08 % of enterococci, 3.89 % of coliform bacteria, 0.06 % of E. coli and 3.49 % of Aeromonas genus for studied well water. On contrary in collected natural spring samples 0.07 % of enterococci, 13.39 % of coliform bacteria, 0.33 % of E. coli and 11.25 % Aeromonas genus were observed. It was optimized method real-time PCR for detection Aeromonas genus directly in water samples. For 5 selected water samples were performed comparing two commercially available kits for real-time PCR - SYBR? Green JumpStartTM Taq ReadyMixTM and KAPA SYBR? fast qPCR kit. The results obtained by method real-time PCR were compared with results obtaining using classical cultivation techniques.
1. Zpracujte literární rešerši na dané téma, zaměřte se na jakost vod podle zákona č. 258/2000 Sb., o ochraně veřejného zdraví a hygienické požadavky na zdravotní nezávadnost a čistotu pitné vody podle vyhlášky č. 252/2004 Sb. Zaměřte se na výskyt a stanovení bakterií rodu Aeromonas ve vodách.
2. V rámci mikrobiologického stanovení indikátorových organismů proveďte dle příslušných norem vyšetření na přítomnost intestinálních enterokoků, koliformních bakterií, Escherichia coli a stanovte počty kolonií vykultivovaných při 22o°C a 36o°C.
3. Ve vyšetřovaných reálných vzorcích vod proveďte stanovení bakterií rodu Aeromonas technikou membránových filtrů s následnou kultivací na vybraných selektivně diagnostických půdách.
4. Kromě klasických kultivačních metod se pokuste stanovit aeromonády ve vzorcích vod také molekulárně biologickými technikami.
5. Zhodnoťte situaci z hlediska požadavků na kvalitu pitné vody.
Zásady pro vypracování
1. Zpracujte literární rešerši na dané téma, zaměřte se na jakost vod podle zákona č. 258/2000 Sb., o ochraně veřejného zdraví a hygienické požadavky na zdravotní nezávadnost a čistotu pitné vody podle vyhlášky č. 252/2004 Sb. Zaměřte se na výskyt a stanovení bakterií rodu Aeromonas ve vodách.
2. V rámci mikrobiologického stanovení indikátorových organismů proveďte dle příslušných norem vyšetření na přítomnost intestinálních enterokoků, koliformních bakterií, Escherichia coli a stanovte počty kolonií vykultivovaných při 22o°C a 36o°C.
3. Ve vyšetřovaných reálných vzorcích vod proveďte stanovení bakterií rodu Aeromonas technikou membránových filtrů s následnou kultivací na vybraných selektivně diagnostických půdách.
4. Kromě klasických kultivačních metod se pokuste stanovit aeromonády ve vzorcích vod také molekulárně biologickými technikami.
5. Zhodnoťte situaci z hlediska požadavků na kvalitu pitné vody.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucí práce.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucí práce.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Student přednesl obhajobu své diplomové práce a zodpověděl dotazy oponenta a členů komise.