Informace o kvalifikační práci Biomarkery oxidativního stresu využitelné při vyhodnocování testů ekotoxicity nanonočástic na roupici Enchytraeus crypticus
Cílem předložené diplomové práce byl výběr a optimalizace ekonomicky nenáročných biochemických testů pro citlivou detekci oxidativního stresu způsobeného nanočásticemi ZnO. Teoretická část práce se zabývá využitím a možnou toxicitou nanočástic ZnO. Dále jsou v ní rozebrány mechanismy indukce oxidativního stresu a nejběžnější způsoby jeho detekce. Pozornost je věnována především biochemickým testům, které jsou použitelné pro půdní bezobratlé. Experimentální část práce se dělí na dvě důležité podkapitoly, jimiž jsou optimalizace vybraných biochemických metod (protein, celkový glutation, malondialdehyd) pro použití na roupicích Enchytraeus crypticus a testy toxicity rozpustného ZnCl2 a nanočástic ZnO dispergovaných v agarovém médiu, při kterých je navržený zoptimalizovaný postup prakticky vyzkoušen.
Anotace v angličtině
The aims of this diploma thesis were to select and optimize low cost biochemical methods for a sensitive detection of oxidative stress caused by ZnO nanoparticles. The theoretical part deals with the application and potential toxicity of ZnO nanoparticles. Furthermore, mechanisms of oxidative stress induction and the most common options of detection are discussed. The main focus is given on biochemical tests that are applicable to soil invertebrates. The experimental part consists of two important subchapters that are an optimization of selected biochemical methods (protein, total glutathione, malondialdehyde) for usage on soil worm Enchytraeus crypticus and toxicity tests soluble ZnCl2 and ZnO nanoparticles dispersed in agar medium where the optimized procedures are practically tested.
Cílem předložené diplomové práce byl výběr a optimalizace ekonomicky nenáročných biochemických testů pro citlivou detekci oxidativního stresu způsobeného nanočásticemi ZnO. Teoretická část práce se zabývá využitím a možnou toxicitou nanočástic ZnO. Dále jsou v ní rozebrány mechanismy indukce oxidativního stresu a nejběžnější způsoby jeho detekce. Pozornost je věnována především biochemickým testům, které jsou použitelné pro půdní bezobratlé. Experimentální část práce se dělí na dvě důležité podkapitoly, jimiž jsou optimalizace vybraných biochemických metod (protein, celkový glutation, malondialdehyd) pro použití na roupicích Enchytraeus crypticus a testy toxicity rozpustného ZnCl2 a nanočástic ZnO dispergovaných v agarovém médiu, při kterých je navržený zoptimalizovaný postup prakticky vyzkoušen.
Anotace v angličtině
The aims of this diploma thesis were to select and optimize low cost biochemical methods for a sensitive detection of oxidative stress caused by ZnO nanoparticles. The theoretical part deals with the application and potential toxicity of ZnO nanoparticles. Furthermore, mechanisms of oxidative stress induction and the most common options of detection are discussed. The main focus is given on biochemical tests that are applicable to soil invertebrates. The experimental part consists of two important subchapters that are an optimization of selected biochemical methods (protein, total glutathione, malondialdehyde) for usage on soil worm Enchytraeus crypticus and toxicity tests soluble ZnCl2 and ZnO nanoparticles dispersed in agar medium where the optimized procedures are practically tested.
1. Vypracujte literární rešerši shrnující problematiku mechanismů vzniku oxidativního stresu na buněčné úrovni. Diskutujte možné dopady zvýšeného výskytu volných radikálů a reaktivních forem kyslíku (ROS) či dusíku (RNS) na jednotlivé biochemické procesy v buňkách. Zvláštní důraz věnujte procesům, které jsou charakteristické pro organismus kroužkovců.
2. Popište hlavní biomarkery prakticky využitelné pro hodnocení míry oxidativního stresu a míry poškození buněk vyvolané tímto procesem. Popište principy stanovení těchto biomarkerů. Zvláštní pozornost věnujte problematice přípravy a zpracování vzorků tkání kroužkovců.
3. Pokuste se navrhnout metodiku hodnocení biomarkerů oxidativního stresu prakticky využitelnou v rámci testů ekotoxicity nanomateriálů prováděných na kroužkovci Enchytraeus crypticus kultivovaném v agarových živných médiích. Zdůvodněte výběr jednotlivých analytických postupů a diskutujte jejich metrologické vlastnosti (detekční limit, reprodukovatelnost, rozsah apod.).
Zásady pro vypracování
1. Vypracujte literární rešerši shrnující problematiku mechanismů vzniku oxidativního stresu na buněčné úrovni. Diskutujte možné dopady zvýšeného výskytu volných radikálů a reaktivních forem kyslíku (ROS) či dusíku (RNS) na jednotlivé biochemické procesy v buňkách. Zvláštní důraz věnujte procesům, které jsou charakteristické pro organismus kroužkovců.
2. Popište hlavní biomarkery prakticky využitelné pro hodnocení míry oxidativního stresu a míry poškození buněk vyvolané tímto procesem. Popište principy stanovení těchto biomarkerů. Zvláštní pozornost věnujte problematice přípravy a zpracování vzorků tkání kroužkovců.
3. Pokuste se navrhnout metodiku hodnocení biomarkerů oxidativního stresu prakticky využitelnou v rámci testů ekotoxicity nanomateriálů prováděných na kroužkovci Enchytraeus crypticus kultivovaném v agarových živných médiích. Zdůvodněte výběr jednotlivých analytických postupů a diskutujte jejich metrologické vlastnosti (detekční limit, reprodukovatelnost, rozsah apod.).
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucího diplomové práce.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucího diplomové práce.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
ilustrace, grafy, schémata, tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Prezentace výsledků diplomové práce.
}
Diskuze k posudku vedoucího a oponenta diplomové práce.
}
Studentka zodpověděla všechny dotazy a připomínky k DP.