Diplomová práce představuje multiplexní metodu polymerázové řetězové reakce pro specifickou detekci rodu Fusarium spolu s průkazem Tri5 genu, klíčového pro produkci trichothecenových mykotoxinů. Dále uvádí metody druhové identifikace fuzárií, se zaměřením na F. graminearum, F. avenaceum, F. sporotrichioides, F. poae, F. langsethiae a F. tricinctum. Optimální metody jsou využity pro hodnocení výskytu plísní rodu Fusarium ve vzorcích ječmene. Poslední část je věnována detekci vybraných trichothecenových mykotoxinů pomocí HPLC/MS.
Annotation in English
The diploma thesis deals with the multiplex polymerase chain reaction for specific detection of fungi genus Fusarium with the detection of Tri5 gene that is required for trichothecene biosynthesis. The thesis includes the species-specific detection of Fusarium and is focused on F. graminearum, F. avenaceum, F. sporotrichioides, F. poae, F. langsethiae and F. tricinctum, which occurrence are evaluated in barley. The last part of thesis achieves the goal of the detection of the selected trichothecene mycotoxins with HPLC/MS.
Keywords
plísně, rod Fusarium, identifikace plísní, fuzarióza klasů, analýza mykotoxinů
Keywords in English
molds, genus Fusarium, identification of molds, Fusarium head blight, analysis of mycotoxins
Length of the covering note
-
Language
CZ
Annotation
Diplomová práce představuje multiplexní metodu polymerázové řetězové reakce pro specifickou detekci rodu Fusarium spolu s průkazem Tri5 genu, klíčového pro produkci trichothecenových mykotoxinů. Dále uvádí metody druhové identifikace fuzárií, se zaměřením na F. graminearum, F. avenaceum, F. sporotrichioides, F. poae, F. langsethiae a F. tricinctum. Optimální metody jsou využity pro hodnocení výskytu plísní rodu Fusarium ve vzorcích ječmene. Poslední část je věnována detekci vybraných trichothecenových mykotoxinů pomocí HPLC/MS.
Annotation in English
The diploma thesis deals with the multiplex polymerase chain reaction for specific detection of fungi genus Fusarium with the detection of Tri5 gene that is required for trichothecene biosynthesis. The thesis includes the species-specific detection of Fusarium and is focused on F. graminearum, F. avenaceum, F. sporotrichioides, F. poae, F. langsethiae and F. tricinctum, which occurrence are evaluated in barley. The last part of thesis achieves the goal of the detection of the selected trichothecene mycotoxins with HPLC/MS.
Keywords
plísně, rod Fusarium, identifikace plísní, fuzarióza klasů, analýza mykotoxinů
Keywords in English
molds, genus Fusarium, identification of molds, Fusarium head blight, analysis of mycotoxins
Research Plan
Teoretická část:
Vypracujte literární rešerši cílenou na problematiku, zaměřte se na výskyt plísní rodu Fusarium v ječmeni a jiném obilí.
Zaměřte se na produkci a analýzu trichothecenových mykotoxinů.
Experimentální část:
Optimalizujte multiplex PCR, pro detekci genu kódujícího produkci trichothecenových mykotoxinů a genu kódující rod Fusarium.
Pokuste se zoptimalizovat PCR pro druhovou identifikaci rodu Fusarium.
Z různých vzorků ječmene a sladu izolujte a identifikujte plísně rodu Fusarium.
Pokuste se zavést metodu HPLC/MS pro detekci a kvantifikaci trichothecenových mykotoxinů.
Research Plan
Teoretická část:
Vypracujte literární rešerši cílenou na problematiku, zaměřte se na výskyt plísní rodu Fusarium v ječmeni a jiném obilí.
Zaměřte se na produkci a analýzu trichothecenových mykotoxinů.
Experimentální část:
Optimalizujte multiplex PCR, pro detekci genu kódujícího produkci trichothecenových mykotoxinů a genu kódující rod Fusarium.
Pokuste se zoptimalizovat PCR pro druhovou identifikaci rodu Fusarium.
Z různých vzorků ječmene a sladu izolujte a identifikujte plísně rodu Fusarium.
Pokuste se zavést metodu HPLC/MS pro detekci a kvantifikaci trichothecenových mykotoxinů.
Recommended resources
Podle pokynů vedoucí práce.
Recommended resources
Podle pokynů vedoucí práce.
Enclosed appendices
-
Appendices bound in thesis
-
Taken from the library
No
Full text of the thesis
Appendices
Reason for not publishing thesis
Reviewer's report
Supervisor's report
Defence procedure record
Studentka seznámila členy zkušební komise s obsahem své diplomové práce, poté byla seznámena s posudky vedoucího a oponenta diplomové práce. Studentka odpověděla na otázky oponenta diplomové práce a členů zkušební komise.