Tato diplomová práce se zabývá detekcí genů rezistence na antibiotika u bakterie
Pseudomonas aeruginosa. Cílem této práce bylo u vybraných kmenů Pseudomonas aeruginosa
stanovit antimikrobiální citlivost a poté zavést metodu multiplexní polymerázové řetězové
reakce pro detekci genů, které souvisejí s rezistencí bakterií na antimikrobiální látky. Po
optimalizaci multiplexní polymerázové řetězové reakce byla provedena detekce genů rezistence
u kmenů získaných ze vzorků chronických ran, výtěrů z krku a tělních tekutin a nemocničních
nebo městských odpadních vod.
Anotace v angličtině
This diploma thesis deals with the detection of antibiotic resistance genes in bacteria
Pseudomonas aeruginosa. The aim of this work was to determine the antimicrobial
susceptibility of selected strains of Pseudomonas aeruginosa and then to optimize a multiplex
polymerase chain reaction method for the detection of genes related to bacterial resistance to
antimicrobials. After optimization of the multiplex polymerase chain reaction, resistance genes
were detected in strains obtained from chronic wound samples, throat and body fluids and
hospital or municipal wastewater.
Tato diplomová práce se zabývá detekcí genů rezistence na antibiotika u bakterie
Pseudomonas aeruginosa. Cílem této práce bylo u vybraných kmenů Pseudomonas aeruginosa
stanovit antimikrobiální citlivost a poté zavést metodu multiplexní polymerázové řetězové
reakce pro detekci genů, které souvisejí s rezistencí bakterií na antimikrobiální látky. Po
optimalizaci multiplexní polymerázové řetězové reakce byla provedena detekce genů rezistence
u kmenů získaných ze vzorků chronických ran, výtěrů z krku a tělních tekutin a nemocničních
nebo městských odpadních vod.
Anotace v angličtině
This diploma thesis deals with the detection of antibiotic resistance genes in bacteria
Pseudomonas aeruginosa. The aim of this work was to determine the antimicrobial
susceptibility of selected strains of Pseudomonas aeruginosa and then to optimize a multiplex
polymerase chain reaction method for the detection of genes related to bacterial resistance to
antimicrobials. After optimization of the multiplex polymerase chain reaction, resistance genes
were detected in strains obtained from chronic wound samples, throat and body fluids and
hospital or municipal wastewater.
1. Zpracujte literární rešerši zaměřenou na zadané téma. V úvodu práce stručně vysvětlete pojem antimikrobiální látky, jejich využití, historii používání. Dále se již věnujte vzniku rezistence bakterií na antimikrobiální látky.
2. Stručně popište metody průkazu rezistence na antimikrobiální látky. \
3. Stěžejní část rešerše věnujte zejména studiím zabývajícím se detekcí genů u bakterií patogenních a podmíněně patogenních, které souvisí s rezistencí bakterií na antibiotika.
Experimentální část:
1. Na sbírkových kmenech otestujte antimikrobiální citlivost.
2. U vybraných bakteriálních kultur se pokuste zavést metodu PCR pro detekci genů souvisejících s rezistencí na konkrétní antimikrobiální látky.
3. Po optimalizaci využijte metodu k detekci genů u bakterií získaných z reálných vzorků - např. z chronických ran, vzorků z nemocničních nebo městských odpadních vod, atd.
4. Výsledky zhodnoťte, vyvoďte závěry a porovnejte s publikovanými pracemi.
5. Diplomovou práci zpracujte v souladu se Směrnicí UPa č. 7/2019 ve znění dodatku č. 2 "Pravidla pro odevzdávání, zveřejňování a formální úpravu závěrečných prací".
Zásady pro vypracování
Teoretická část:
1. Zpracujte literární rešerši zaměřenou na zadané téma. V úvodu práce stručně vysvětlete pojem antimikrobiální látky, jejich využití, historii používání. Dále se již věnujte vzniku rezistence bakterií na antimikrobiální látky.
2. Stručně popište metody průkazu rezistence na antimikrobiální látky. \
3. Stěžejní část rešerše věnujte zejména studiím zabývajícím se detekcí genů u bakterií patogenních a podmíněně patogenních, které souvisí s rezistencí bakterií na antibiotika.
Experimentální část:
1. Na sbírkových kmenech otestujte antimikrobiální citlivost.
2. U vybraných bakteriálních kultur se pokuste zavést metodu PCR pro detekci genů souvisejících s rezistencí na konkrétní antimikrobiální látky.
3. Po optimalizaci využijte metodu k detekci genů u bakterií získaných z reálných vzorků - např. z chronických ran, vzorků z nemocničních nebo městských odpadních vod, atd.
4. Výsledky zhodnoťte, vyvoďte závěry a porovnejte s publikovanými pracemi.
5. Diplomovou práci zpracujte v souladu se Směrnicí UPa č. 7/2019 ve znění dodatku č. 2 "Pravidla pro odevzdávání, zveřejňování a formální úpravu závěrečných prací".
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucí práce.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucí práce.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Odůvodnění nezveřejnění VŠKP
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Student seznámil členy zkušební komise s obsahem své diplomové práce, poté byl seznámen s posudky vedoucího a oponenta diplomové práce. Student odpověděl na otázky oponenta diplomové práce a členů zkušební komise.