Diplomová práce se zabývá nalezením optimálního způsobu izolace RNA z různých druhů kvasinek v maximálním možném množství a čistotě, zejména z nepatogenních kvasinek (Saccharomyces cerevisiae) a patogenních kvasinek (Candida albicans a Candida parapsilosis). V teoretické části jsou popsány základní informace o těchto kvasinkách a využití transkriptomických analýz ke studiu jejich genové regulace. Zmíněna je také charakteristika metody PCR a její použití pro transkripci RNA.
Praktická část ve druhé části práce obsahuje dílčí kroky kultivace různých druhů kvasinek, izolaci RNA pomocí dvou různých izolačních metod (extrakční činidlo TRIzol-fenol chloroform a Quick-RNA Viral Kit) a elektroforetickou analýzu získané RNA.
Anotace v angličtině
The diploma thesis deals with finding the optimal way to isolate RNA from different species of yeasts in the maximal possible amount and purity, especially from the non-pathogenic yeast (Saccharomyces cerevisiae) and pathogenic yeasts (Candida albicans and Candida parapsilosis). The theoretical section describes the basic information about these yeasts and utilization of transcriptomic analyses to study of their gene regulation. The characteristics of the PCR method, as well as its use for RNA transcription, are also mentioned.
The practical section in the second part of the thesis contains partial steps of cultivation of different yeast species, RNA isolation using two different isolation methods (TRIzol reagent-phenol chloroform extraction and Quick-RNA Viral Kit), and the electrophoretic analysis of the obtained RNA.
Diplomová práce se zabývá nalezením optimálního způsobu izolace RNA z různých druhů kvasinek v maximálním možném množství a čistotě, zejména z nepatogenních kvasinek (Saccharomyces cerevisiae) a patogenních kvasinek (Candida albicans a Candida parapsilosis). V teoretické části jsou popsány základní informace o těchto kvasinkách a využití transkriptomických analýz ke studiu jejich genové regulace. Zmíněna je také charakteristika metody PCR a její použití pro transkripci RNA.
Praktická část ve druhé části práce obsahuje dílčí kroky kultivace různých druhů kvasinek, izolaci RNA pomocí dvou různých izolačních metod (extrakční činidlo TRIzol-fenol chloroform a Quick-RNA Viral Kit) a elektroforetickou analýzu získané RNA.
Anotace v angličtině
The diploma thesis deals with finding the optimal way to isolate RNA from different species of yeasts in the maximal possible amount and purity, especially from the non-pathogenic yeast (Saccharomyces cerevisiae) and pathogenic yeasts (Candida albicans and Candida parapsilosis). The theoretical section describes the basic information about these yeasts and utilization of transcriptomic analyses to study of their gene regulation. The characteristics of the PCR method, as well as its use for RNA transcription, are also mentioned.
The practical section in the second part of the thesis contains partial steps of cultivation of different yeast species, RNA isolation using two different isolation methods (TRIzol reagent-phenol chloroform extraction and Quick-RNA Viral Kit), and the electrophoretic analysis of the obtained RNA.
Obecný popis patogenních a nepatogenních kvasinek (např. Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida parapsilosis a dalších), využití transkriptomických analýz pro studium genové regulace v kvasinkách.
Charakteristika metody real-time PCR a jejího využití.
Experimentální část:
Kultivace různých druhů kvasinek (např. Saccharomyces cerevisiae, C. albicans a C. parapsilosis).
Izolace RNA pomocí různých izolačních metod/kitů.
Elektroforetická analýza získané RNA.
Zásady pro vypracování
Teoretická část:
Obecný popis patogenních a nepatogenních kvasinek (např. Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, Candida parapsilosis a dalších), využití transkriptomických analýz pro studium genové regulace v kvasinkách.
Charakteristika metody real-time PCR a jejího využití.
Experimentální část:
Kultivace různých druhů kvasinek (např. Saccharomyces cerevisiae, C. albicans a C. parapsilosis).
Izolace RNA pomocí různých izolačních metod/kitů.
Elektroforetická analýza získané RNA.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucího diplomové práce.
Seznam doporučené literatury
Podle pokynů vedoucího diplomové práce.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
schémata, tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
1. Prezentace výsledků diplomové práce.
2. Diskuze k posudkům vedoucího a oponenta diplomové práce.
3. Studentka zodpověděla všechny dotazy a připomínky k DP.