Diplomová práce pojednává o bakteriích Arcobacter-like species. Jsou zde zahrnuty základní informace o jejich taxonomii, výskytu, patogenitě, možnostech izolace a identifikace. Experimenty studie jsou zaměřené na problematiku identifikace bakterií Arcobacter-like species z různých vzorků. Cílem studie je zavedení a optimalizace metody plynové chromatografie s plamenově-ionizačním detektorem (GC-FID) jako možného nástroje pro identifikaci kmenů Arcobacter-like species. Jednotlivé kmeny arkobakterů byly identifikovány také pomocí několika protokolů molekulárně-biologických metod (mPCR, 16S rRNA
PCR-RFLP).
Anotace v angličtině
The master thesis deals with Arcobacter-like species. Basic information in their taxonomy, occierence, pathogenicity, isolation and identification possibilities are included. The experiments of the study are focused on the problem of identification of Arcobacter-like species from different samples. The aim of the study is the introduction and optimization of the gas chromatography-flame ionization detector (GC-FID) method as possible tool for the identification of Arcobacter-like species strains. Individual Arcobacter strains were also identified using several molecular biology protocols (mPCR, 16S rRNA PCR-RFLP).
Diplomová práce pojednává o bakteriích Arcobacter-like species. Jsou zde zahrnuty základní informace o jejich taxonomii, výskytu, patogenitě, možnostech izolace a identifikace. Experimenty studie jsou zaměřené na problematiku identifikace bakterií Arcobacter-like species z různých vzorků. Cílem studie je zavedení a optimalizace metody plynové chromatografie s plamenově-ionizačním detektorem (GC-FID) jako možného nástroje pro identifikaci kmenů Arcobacter-like species. Jednotlivé kmeny arkobakterů byly identifikovány také pomocí několika protokolů molekulárně-biologických metod (mPCR, 16S rRNA
PCR-RFLP).
Anotace v angličtině
The master thesis deals with Arcobacter-like species. Basic information in their taxonomy, occierence, pathogenicity, isolation and identification possibilities are included. The experiments of the study are focused on the problem of identification of Arcobacter-like species from different samples. The aim of the study is the introduction and optimization of the gas chromatography-flame ionization detector (GC-FID) method as possible tool for the identification of Arcobacter-like species strains. Individual Arcobacter strains were also identified using several molecular biology protocols (mPCR, 16S rRNA PCR-RFLP).
Teoretická část:
Seznamte se s literárními prameny v dané oblasti a vypracujte rešerši vztahující se k zadanému tématu. V úvodu práce se věnujte shrnutí základních informací o bakteriích čeledi Arcobacteraceae.
Zpracujte literární rešerši o možnostech bakteriální typizace, zejména se zaměřením na analýzu profilu mastných kyselin a molekulárně-biologické metodiky.
Experimentální část:
Zaveďte a optimalizujte metodu plynové chromatografie s hmotnostní detekcí (GC/MS) jako možný nástroj identifikace kmenů "Arcobacter-like species" v prostředí laboratoří katedry.
Identifikujte předložené izoláty "Arcobacter-like species" molekulárně-biologickými metodikami. Výsledky srovnejte se zjištěným profilem MK. Všímejte si případných rozdílů v profilu mastných kyselin jednotlivých bakteriálních druhů, popř. kmenů.
Získané výsledky vhodným způsobem interpretujte.
Diplomovou práci zpracujte v souladu se Směrnicí č. 7/2019 Univerzity Pardubice "Pravidla pro odevzdávání, zveřejňování a formální úpravu závěrečných prací" ve znění navazujících dodatků.
Zásady pro vypracování
Teoretická část:
Seznamte se s literárními prameny v dané oblasti a vypracujte rešerši vztahující se k zadanému tématu. V úvodu práce se věnujte shrnutí základních informací o bakteriích čeledi Arcobacteraceae.
Zpracujte literární rešerši o možnostech bakteriální typizace, zejména se zaměřením na analýzu profilu mastných kyselin a molekulárně-biologické metodiky.
Experimentální část:
Zaveďte a optimalizujte metodu plynové chromatografie s hmotnostní detekcí (GC/MS) jako možný nástroj identifikace kmenů "Arcobacter-like species" v prostředí laboratoří katedry.
Identifikujte předložené izoláty "Arcobacter-like species" molekulárně-biologickými metodikami. Výsledky srovnejte se zjištěným profilem MK. Všímejte si případných rozdílů v profilu mastných kyselin jednotlivých bakteriálních druhů, popř. kmenů.
Získané výsledky vhodným způsobem interpretujte.
Diplomovou práci zpracujte v souladu se Směrnicí č. 7/2019 Univerzity Pardubice "Pravidla pro odevzdávání, zveřejňování a formální úpravu závěrečných prací" ve znění navazujících dodatků.
Seznam doporučené literatury
-
Seznam doporučené literatury
-
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
ilustrace
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
1. Prezentace výsledků diplomové práce.
2. Diskuze k posudkům vedoucího a oponenta diplomové práce.
3. Student/ka zodpověděl/la všechny dotazy a připomínky k DP.