Diplomová práce se zabývala výskytem a přežíváním arkobakterů ve vodách. Postup optimalizace metody multiplex PCR byl ověřen na sbírkových kmenech Arcobacter cryaerophilus CCM 3934 a Arcobacter butzleri CCUG 3084. Dále byla vybrána nejvhodnější metoda pro záchyt arkobakterů z vod. Nejlepší výsledky poskytovala metoda založená na filtraci, obohacení v Arcobacter mediu se selektivní suplementem SR 174E a následném vyočkování na stejné agarové medium. U uměle kontaminovaných vzorků vod byla sledována doba přežívání. Toto přežívání bylo prováděno při různých teplotách. Nejdéle přežíval A. butzleri při 4 °C ve studniční vodě (84 dní). Metodou multiplex PCR bylo vyšetřeno 5 vzorků vod. A. butzleri byl nalezen v 1 případě (20 %).
Anotace v angličtině
This thesis occupies with an occurrence and a survival of arcobacters in water. A progress of optimization of the multiplex PCR method was verified on reference strains of Arcobacter cryaerophilus CCM 3934 and Arcobacter butzleri CCUG 3084. Next, the most suitable method was chosen for an interception of arcobacters from water. The best results were provided by a method based on filtration, fortification in Arcobacter medium with the selective supplement SR 174E and subsequent planting on the same agar medium. Concerning artificially contaminated water samples, the survival period was investigated. This survival of arcobacters was observed on different temperature conditions. The longest survival period was provided by A. butzleri in well water by 4 °C (84 days). 5 samples of water were examined using multiplex PCR. A. butzleri was found in 1 case (20 %).
Klíčová slova
Arcobacter, přežívání, voda, polymerázová řetězová reakce
Diplomová práce se zabývala výskytem a přežíváním arkobakterů ve vodách. Postup optimalizace metody multiplex PCR byl ověřen na sbírkových kmenech Arcobacter cryaerophilus CCM 3934 a Arcobacter butzleri CCUG 3084. Dále byla vybrána nejvhodnější metoda pro záchyt arkobakterů z vod. Nejlepší výsledky poskytovala metoda založená na filtraci, obohacení v Arcobacter mediu se selektivní suplementem SR 174E a následném vyočkování na stejné agarové medium. U uměle kontaminovaných vzorků vod byla sledována doba přežívání. Toto přežívání bylo prováděno při různých teplotách. Nejdéle přežíval A. butzleri při 4 °C ve studniční vodě (84 dní). Metodou multiplex PCR bylo vyšetřeno 5 vzorků vod. A. butzleri byl nalezen v 1 případě (20 %).
Anotace v angličtině
This thesis occupies with an occurrence and a survival of arcobacters in water. A progress of optimization of the multiplex PCR method was verified on reference strains of Arcobacter cryaerophilus CCM 3934 and Arcobacter butzleri CCUG 3084. Next, the most suitable method was chosen for an interception of arcobacters from water. The best results were provided by a method based on filtration, fortification in Arcobacter medium with the selective supplement SR 174E and subsequent planting on the same agar medium. Concerning artificially contaminated water samples, the survival period was investigated. This survival of arcobacters was observed on different temperature conditions. The longest survival period was provided by A. butzleri in well water by 4 °C (84 days). 5 samples of water were examined using multiplex PCR. A. butzleri was found in 1 case (20 %).
Klíčová slova
Arcobacter, přežívání, voda, polymerázová řetězová reakce