Cílem předmětu je seznámení studentů s využitím hmotnostní spektrometrie při identifikaci organických sloučenin. Jsou řešeny vhodné typy ionizace vzorků a používané hmotnostní analyzátory. S ohledem na kombinované vlastnosti vzorků (směs látek, čistá látka, rozpustné a nerozpustné látky, dle polarity nebo molekulové hmotnosti) jsou diskutovány možnosti propojení hmotnostní spektrometrie s různými používanými separačními metodami. Řešeno je i hledisko citlivosti a přesnosti měření ve vztahu k použitým experimentálním technikám. Důraz je především kladen na praktické vyhodnocování hmotnostních spekter organických látek se zaměřením na fragmentační spektra získaná pomocí EI-MS analýzy.