- Následující požadované údaje nejsou u této VŠKP vyplněny: Název dle studenta, Název v angličtině, Anotace, Anotace v angličtině, Klíčová slova, Klíčová slova v angličtině
Hlavní téma
Metoda izolace His-tag proteinů pomocí TiO2/Fe3O4 s důrazem na čistotu finálního produktu
Hlavní téma v angličtině
Isolation of His-Tag Proteins by TiO2/Fe3O4 Solid Phase With the Impact to the Purity of Final Product
Teoretická část:
1) Stručně popište výrobu rekombinantních proteinů. Při studiu odborné literatury se zaměřte na metody, kde jsou výsledné produkty modifikovány tzv. afinitní kotvou ("affinity tag") pro usnadněnou izolaci a purifikaci proteinů. Nejvíce se věnujte problematice výroby a metodám izolace His-tagovaných rekombinantních proteinů (IMAC).
2) Prostudujte recentní literaturu popisující princip všech dnes dostupných separačních technik vhodných pro izolace His-tag proteinů. Popište i možné kontaminace výsledného produktu, největší pozornost věnujte lipopolysacharidům bakteriálních buněk. Uveďte, jaká rizika jsou s touto kontaminací spjatá v případě použití rekombinantního proteinu v rámci biologické léčby.
3) Popište materiály používané v praxi pro izolace His-tag proteinů.
4) Vypracujte teoretickou část na dané téma v délce 30 - 40 normovaných stran včetně obrázků a schémat. Při vyhledávání literárních údajů využijte všech dostupných databází NCBI, PubMed, Scopus, WOS a další dle pokynů školitele.
Experimentální část:
1) Naučte se IMAC techniku pro izolaci His-tag proteinů, k analýze elučních frakcí použijte elektroforetické metody pro analýzu proteinů.
2) K izolaci His-tag proteinů použijte i nové materiály, konkrétně magneticky aktivní TiO2 nanotrubičky.
3) Pro optimalizaci separačních podmínek použijte modelových směsi proteinů s His-tag proteinem.
4) Zaveďte metodu pro detekci lipopolysacharidů a tuto použijte pro kontrolu čistoty izolovaných His-tag proteinů.
5) Vlastní výsledky porovnejte s komerčními nosiči, s technikou IMAC a zhodnoťte v kontextu dostupných literárních zdrojů.
Zásady pro vypracování
Teoretická část:
1) Stručně popište výrobu rekombinantních proteinů. Při studiu odborné literatury se zaměřte na metody, kde jsou výsledné produkty modifikovány tzv. afinitní kotvou ("affinity tag") pro usnadněnou izolaci a purifikaci proteinů. Nejvíce se věnujte problematice výroby a metodám izolace His-tagovaných rekombinantních proteinů (IMAC).
2) Prostudujte recentní literaturu popisující princip všech dnes dostupných separačních technik vhodných pro izolace His-tag proteinů. Popište i možné kontaminace výsledného produktu, největší pozornost věnujte lipopolysacharidům bakteriálních buněk. Uveďte, jaká rizika jsou s touto kontaminací spjatá v případě použití rekombinantního proteinu v rámci biologické léčby.
3) Popište materiály používané v praxi pro izolace His-tag proteinů.
4) Vypracujte teoretickou část na dané téma v délce 30 - 40 normovaných stran včetně obrázků a schémat. Při vyhledávání literárních údajů využijte všech dostupných databází NCBI, PubMed, Scopus, WOS a další dle pokynů školitele.
Experimentální část:
1) Naučte se IMAC techniku pro izolaci His-tag proteinů, k analýze elučních frakcí použijte elektroforetické metody pro analýzu proteinů.
2) K izolaci His-tag proteinů použijte i nové materiály, konkrétně magneticky aktivní TiO2 nanotrubičky.
3) Pro optimalizaci separačních podmínek použijte modelových směsi proteinů s His-tag proteinem.
4) Zaveďte metodu pro detekci lipopolysacharidů a tuto použijte pro kontrolu čistoty izolovaných His-tag proteinů.
5) Vlastní výsledky porovnejte s komerčními nosiči, s technikou IMAC a zhodnoťte v kontextu dostupných literárních zdrojů.
Seznam doporučené literatury
-
Seznam doporučené literatury
-
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
1/ Prezentace výsledků diplomové práce.
2/ Diskuze k posudkům vedoucího a oponenta diplomové práce.
3/ Studentka zodpověděla všechny dotazy a připomínky k DP.